经过几年的努力，我区科技创新体系基本形成，创新能力显著增强，创新绩效明显提升，创新水平站在了新的起点上。自治区党委、政府及科技厅相继出台有关科技计划调整、项目经费管理、决策咨询、项目储备库建设、科技成果转化等一系列配套的科技改革措施，多项改革均走在了兄弟省市的前列，特别是大胆改革科技项目形成机制和管理办法，出台了《自治区科技储备项目管理暂行办法》，修订了《科技计划项目管理办法》，改革措施得到了科技部的充分肯定。通过全面实施科技成果转化、关键技术攻关、平台载体建设三大工程，在新材料、清洁能源、装备制造、绿色农牧业、生态环境等领域取得一批重大科技创新成果，科技进步贡献率由2011年的35%增加到2016年的45%，成功培育3个国家级重点实验室，呼和浩特金山开发区和鄂尔多斯高新区升级为国家高新区，高新技术企业超过500家，是5年前的3倍，全区拥有各类创新平台载体共874家，其中80%以上是近5年来建成的。
2012年底，自治区政府启动实施了科技重大专项，实施项目400多项，自治区财政投入20亿元，带动地方和企业投入60多亿元，在提升科技创新能力、引进培养高层次人才、促进产业转型升级等方面发挥了重要作用。目前科技重大专项已取得一批关键技术突破，近期取得的两项重要产业化成果包括：世界首条稀土硫化物着色剂连续化隧道窑生产线在包头建成，并成功实现产业化；热镀钢(铝)复合板热转印彩印板技术在我区成功实现产业化。
5年来，自治区政府通过大力实施项目、人才和平台三位一体工程，积极推动创新平台载体的提档升级和合理布局，在数量大幅增长、功能不断完善的同时，国家级平台载体建设取得新的突破，特别是新增3个国家重点实验室、两个国家级高新区、6个国家级农业科技园区和5个国家级可持续发展实验区，与数百家国家和自治区级平台载体组成的创新体系功能不断完善，能力水平得到新的提升。今年9月4日，科技部、自治区政府联合印发了《关于批准建设省部共建草原家畜生殖调控与繁育国家重点实验室的通知》，标志着我区省部共建国家重点实验室实现了零的突破，该实验室依托内蒙古大学，围绕国家现代畜牧业发展实际需求，以草原家畜繁育相关重大共性科学问题和关健技术为突破口，聚焦草原家畜生殖调控、草原家畜遗传繁育和家畜遗传与环境互作3个研究方向开展基础和应用基础研究，为提升草原家畜繁殖效率、选育草原家畜新品种、建立草原生态养殖模式以及我区畜牧业转型升级、增强竞争力提供科技支撑。同时，我区培育的第4个国家级高新区(赤峰高新区)升级工作进展顺利。